按照李祖文 2004 年發表的"台灣產石竹亞科植物之分類研究"，石竹屬分為 5 種，分別是：巴陵石竹、玉山石竹、清水山石竹 、長萼瞿麥、瞿麥。
石竹屬檢索表 ( 台灣產石竹亞科植物之分類研究 國立臺灣師範大學生命科學研究所 2004 李祖文 )
1. 植株高度小於15cm；葉線形；萼筒綠色雜有紫色，萼筒長約 18 mm-----Dianthus pygmaeus 玉山石竹
1. 植株高度大於25cm；葉披針形或披針狀線形；萼筒長約 25-40 mm
2. 瓣簷絲狀裂長度小於1/4--------------------------------------------------- Dianthus palinensis 巴陵石竹
2. 瓣簷絲狀裂長度大於1/4
3. 莖和葉表面綠色；基生葉排列鬆散，葉緣有粗毛；節稍微膨大
4. 萼筒長約 25-30 mm，通常紅紫色----------------------------- Dianthus superbus var. superbus 瞿麥
4. 萼筒長約 30-40 mm，綠色-------------------------- Dianthus superbus var. longicalycinus 長萼瞿麥
3. 莖和葉表面綠色具白粉；基生葉十字對生，緊密排列，葉緣有粗毛；節明顯膨大------- Dianthus seisuimontanus 清水山石竹
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先貼巴陵石竹，它跟其他四種不同的是：巴陵石竹花瓣簷淺裂，裂的程度不及1/4；其他四種花瓣簷裂的程度皆超過1/4。
巴陵石竹的莖和葉表面綠色；基生葉排列鬆散，葉緣有粗毛。
巴陵石竹 Dianthus palinensis
台灣特有種，分布範圍局限於桃園、新竹、南投等低中海拔地區。
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其次是：常見的長萼瞿麥
綠色的萼筒長約 3-4 cm；花瓣粉紅色，但偶有白色的。
長萼瞿麥 Dianthus superbus var. longicalycinus
產亞洲東部，台灣的長萼瞿麥產於低至高海拔山區。
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再來是瞿麥
瞿麥的萼筒顏色偏紅紫色，萼筒長 2.5-3 cm。
瞿麥 Dianthus superbus var. superbus
產亞洲東部，台灣的瞿麥產於中高海拔草生地或溪谷。
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玉山石竹是這幾種石竹中的矮個子，株高頂多 15 cm ；萼筒也短 (1.7-2cm)，萼筒為綠色雜有紫色。僅見於 3000 m 以上高海拔岩屑地。
玉山石竹 Dianthus pygmaeus
台灣特有種，主要分布於於高海拔岩屑地。
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參考資料：台灣產石竹亞科植物之分類研究 ( 李祖文， 2004 年)
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